나라장터 세금계산서 발행 방법, 선금·대금청구 단계별 정리 (2026)

나라장터 세금계산서 발행은 선금청구서와 대금청구서를 작성하는 화면 안에서 합니다. 업체가 청구서의 [세금계산서] 버튼으로 전자세금계산서를 작성해 송신하고, 수요기관은 대금청구서를 접수하면서 그 세금계산서를 승인합니다. 이 글은 조달청이 나라장터 고객센터에 올린 선금·검사검수·대금관리 메뉴 가이드와 FAQ, 부가가치세법과 계약예규 원문으로 발행 위치, 필요한 인증서, 전송 실패 때 재송신하는 방법, 선금 정산과 세금계산서 금액의 관계를 정리합니다.

청구 절차 전체(보증서, 공동수급, 지연이자)는 나라장터 선금청구·대금청구 완전가이드에 따로 있습니다. 이 글은 그중 세금계산서와 인증서, 오류 처리만 다룹니다.

나라장터 세금계산서 발행 위치

조달청 메뉴 가이드(나라장터 FAQ 225 첨부)는 세금계산서 발행을 청구서 작성 단계 안에 넣었습니다. 가이드는 선금청구서 작성 단계에 "청구정보 입력, 보증신청, 계산서 발행 등"을, 대금청구서 작성 단계에 "계산서 발행 및 계좌정보·업체정보 등 최종 확인"을 넣었습니다. 발행한 뒤 다시 찾거나 재송신할 때 쓰는 메뉴는 따로 있습니다.

단계	업체 메뉴(일반계약)	세금계산서 처리
선금청구	계약 > 계약체결 > 계약체결관리목록 → [선금청구서]	청구서 화면 [세금계산서] → 정보 입력 → [송신]
대금청구(기성금·준공금·완수금)	이행 > 검사검수 > 검사검수목록 → [대금청구서]	계산서 발행 후 청구서 [저장]·[송신]
수요기관 접수	이행 > 대금관리 > 대금관리목록조회(기관 화면)	[청구정보] 탭 [세금계산서] → [승인]
전송 실패	이행 > 대금관리 > 세금계산목록조회	[재발급대상] 검색 → [정정세금계산서] 재송신

두 가지를 먼저 알아 둡니다. 첫째, 이 가이드는 "이용 건수가 많은 물품분야의 계약·납품요구 건 위주로 설명"했고 "공사·용역분야도 메뉴 구조는 유사하니 참고는 가능"하다고 적었습니다. 공사·용역 화면의 세부 버튼 이름은 다를 수 있습니다. 둘째, 일반계약은 나라장터에서, 종합쇼핑몰 납품요구 건은 종합쇼핑몰 마이페이지에서 처리합니다.

선금청구서에서 세금계산서 발행하는 순서

메뉴 가이드가 적은 선금청구서 작성 순서는 이렇습니다.

청구 대상 찾기: 계약 > 계약체결 > 계약체결관리목록에서 선금을 청구할 계약을 조회합니다. 종합쇼핑몰 납품요구 건은 주문 > 납품요구에서 찾습니다.
작성 화면 열기: 계약 상세화면 하단의 [선금청구서] 버튼을 누릅니다. 납품요구 건은 [연계문서] 팝업의 [선금급청구서 작성]입니다.
청구정보 입력: 선금요청정보, 선금대상금액, 선금입금계좌, 첨부문서 네 탭을 채웁니다.
보증신청: 화면 하단 [보증신청]에서 [신규 보증요청 등록]으로 보증요청서를 발송합니다. 보증 절차는 나라장터 보증요청 완전가이드에 있습니다.
세금계산서 송신: 탭 화면 하단 [세금계산서]를 누르고 팝업에 정보를 입력한 뒤 [송신]합니다.
청구서 송신: 청구정보, 보증신청, 계산서 발행을 마치면 [저장]과 [송신]을 누릅니다.

진행 상태는 이행 > 대금관리 > 대금관리목록조회에서 봅니다. 공동수급체라면 대표사가 선금청구서를 작성할 때 보낸 "선금청구확인요청"을 공동수급사와 수요기관이 확인하는 절차가 더 붙는다고 가이드는 적었습니다.

선금 자체의 기준은 「정부 입찰ㆍ계약 집행기준」에 있습니다. 2026년 4월 1일 개정된 제34조는 공사, 물품 제조, 용역 계약 모두 계약금액의 100분의 70을 넘지 않는 범위에서 선금을 지급할 수 있게 했습니다. 최초 신청은 원칙적으로 계약 종류와 금액 구간별 비율(공사·물품 제조·용역은 100분의 30~~50, 수해복구공사는 100분의 50~~70) 안에서 지급하고, 청구를 받은 날부터 14일 이내에 지급합니다. 같은 개정으로 선금을 요청할 때 선금사용계획서와 그 계약만을 위한 선금전용계좌를 내도록 했습니다. 이 비율과 기한은 계약서와 집행기준 현행 원문이 정본이며 개정될 수 있습니다.

대금청구서(기성금·준공금·완수금)에서 세금계산서 발행

나라장터 FAQ는 기성금, 준공금, 완수금 청구 경로를 두 가지로 안내합니다.

방법 1: 이행 > 검사검수 > 검사검수목록에서 청구할 건을 누르고 상세화면 하단 [대금청구서]를 누릅니다.
방법 2: 이행 > 대금관리 > 대금관리목록에서 [대금청구대상보기]를 눌러 파란색으로 바꾸고, 청구할 건을 클릭해 음영이 바뀌면 [대금청구서]를 누릅니다.

가이드 기준으로 청구 대상은 물납영수증이 작성된 건입니다. 가이드는 대금청구서를 "물납영수증 등에 기반"해 작성한다고 적었고, 화면에서 "계산서 발행 및 계좌정보·업체정보 등 최종 확인 후 [저장] 및 [송신]"하도록 안내합니다. 물납영수증까지 가는 검사검수 절차는 나라장터 계약관리 완전가이드와 나라장터 검사요청 완전가이드에 있습니다.

수요기관 쪽에서는 대금청구서 상세화면의 [청구정보] 탭에서 [세금계산서]를 눌러 팝업에서 [승인]하고, [업체정보] 탭을 확인한 뒤 [접수]합니다. 기관 화면에는 업체의 국세·관세 완납 여부, 4대 사회보험 완납 여부, 지급계좌를 확인하는 버튼이 있습니다. 공동계약이면 대표사가 청구서를 송신하고, 공동수급사는 대금관리목록에서 대금청구확인요청서를 접수해 확인서를 송신합니다.

대가 지급 기한은 국가계약법 시행령 제58조에 있습니다. 검사를 마친 뒤 청구를 받은 날부터 5일(공휴일과 토요일 제외) 이내에 지급하고, 기성부분 대가는 적어도 30일마다 지급합니다. 청구 내용이 부당하면 발주기관은 사유를 적어 청구서를 반송할 수 있고, 반송한 날부터 다시 청구한 날까지는 지급 기간에 넣지 않습니다(같은 조 제5항). 기한 수치는 계약서와 현행 법령이 정본이며 개정될 수 있습니다.

세금계산서 발행에 쓰는 인증서와 입찰용 인증서 차이

입찰서와 계약서에 서명하는 사업자용 인증서와 세금계산서를 발행하는 인증서는 허용 범위가 다릅니다. 나라장터 FAQ 220은 전자서명에 허용되는 사업자용 인증서를 "사용자용 범용 공동인증서, 사업자용 금융거래용 금융인증서, 개인사업자용 간편인증 인증서"로 적고, 이어서 "세금계산서 업무의 경우 전자세금계산서 업무용인증서가 필요합니다. 사용자용 범용 공동인증서, 사업자용 전자세금계산서용 금융인증서만 허용됨"이라고 안내합니다('사용자용'은 원문 표기).

인증서	입찰·계약 전자서명	세금계산서 업무
사업자용 범용 공동인증서	사용	사용
사업자용 금융인증서	금융거래용 사용	전자세금계산서용만 사용
사업자용 간편인증서	사용(FAQ 220은 개인사업자용으로 표기)	전자세금계산서용 인증서 별도 발급

조달청이 2026년 9월 30일 올리고 10월 16일 수정한 「인증서 발급 신청 안내」는 개인·법인 사업자용 간편인증서에 대해 "전자세금계산서용 인증서 별도 발급 필요(시중은행에서 발급)"라고 적고, 사업자용 범용 공동인증서는 "입찰, 전자세금계산서 등 대부분 업무에 사용 가능"하다고 적습니다. 허용 목록은 공지 시점 기준이며 바뀔 수 있습니다.

세금계산서를 보낼 인증서도 나라장터에 등록돼 있어야 합니다. 등록 메뉴는 이용자관리 > 기관/업체인증서정보관리 > 인증서추가/삭제이고, 관리자 권한을 가진 이용자만 등록할 수 있습니다. 인증서를 갱신하거나 재발급하면 다시 등록합니다. 자세한 등록 순서는 나라장터 인증서 종류와 등록·갱신에 있습니다.

로그인 방식도 확인합니다. 조달청 공지 739에 따르면 2026년 6월 25일 20시 이후 아이디·비밀번호로 로그인한 이용자는 계약서 작성, 대금 청구 등에서 2차 인증을 거칩니다. 개인용 간편인증 등으로 로그인하면 2차 인증이 필요하지 않습니다. 2차 인증 도입 배경은 나라장터 로그인 2차인증 도입 안내에 있습니다.

세금계산서 전송 실패와 정정세금계산서 재송신

나라장터의 전자세금계산서는 국세청 연계 서비스로 처리됩니다. 전송에 실패한 건은 청구서를 처음부터 다시 쓰지 않고 세금계산서 목록에서 재송신합니다. FAQ 225 첨부 가이드가 적은 순서입니다.

이행 > 대금관리 > 세금계산목록조회로 갑니다. 종합쇼핑몰 건은 마이페이지 > 주문 > 세금계산서 > 세금계산서목록입니다.
검색조건 [처리구분]에서 [재발급대상]을 고르고 검색합니다.
해당 건을 눌러 상세화면 오른쪽 아래 [정정세금계산서]를 누르고 재송신합니다.

같은 가이드가 적은 조치법은 세 가지입니다.

확인할 것	원문 안내
승인번호	세금계산서 승인번호 앞 8자리는 작성일자를 근거로 채번, 채번 오류 시 재송신
수량·단가	거래명세내역의 수량과 단가는 소수점 둘째 자리까지 입력
글자 수	거래명세내역은 글자 수 제한이 있어 넘지 않게 입력

거래명세내역은 항목 오른쪽 수정 버튼을 누르면 거래명세내역상세에서 고칠 수 있고, 수정한 뒤 수정완료를 누릅니다.

정정세금계산서와 수정세금계산서는 다른 말입니다

나라장터 가이드의 '정정세금계산서'는 전송에 실패한 건을 다시 보내는 화면 기능입니다. 부가가치세법의 '수정세금계산서'는 이미 발급한 세금계산서의 기재사항이 잘못됐거나 발급 뒤 정해진 사유가 생겼을 때 새로 발급하는 세금계산서입니다(법 제32조제7항). 시행령 제70조제1항이 정한 사유 가운데 공공계약에서 생길 수 있는 것은 이렇습니다.

사유	시행령 제70조제1항의 발급 방법
계약 해제로 공급되지 않음(제2호)	계약해제일을 작성일로 적고 비고란에 처음 작성일을 덧붙여 붉은색 또는 음(-)의 표시로 발급
계약 해지 등으로 공급가액이 늘거나 줄어듦(제3호)	증감 사유가 생긴 날을 작성일로 적고 늘어난 금액은 검은색, 줄어든 금액은 붉은색 또는 음의 표시로 발급
필요적 기재사항을 착오로 잘못 적음(제5호)	처음 발급한 내용대로 붉은색 또는 음의 표시로 발급하고, 고친 세금계산서를 검은색으로 발급(경정을 미리 안 경우 제외)
착오로 전자세금계산서를 이중 발급(제7호)	처음 발급한 내용대로 음의 표시로 발급
면세 등 발급 대상이 아닌 거래에 발급(제8호)	처음 발급한 내용대로 붉은색 또는 음의 표시로 발급

조달청 FAQ와 메뉴 가이드에는 이 사유별 수정세금계산서를 나라장터 화면에서 발급하는 절차가 나와 있지 않습니다. 계약금액이 바뀌거나 계약이 해제돼 이미 보낸 세금계산서의 금액이 달라지면, 계약 담당 부서와 세무 처리 기준을 함께 맞춘 뒤 발급합니다.

전자세금계산서 의무도 법령에 있습니다. 법인사업자와 직전 연도 사업장별 공급가액(면세공급가액 포함) 합계가 8천만원 이상인 개인사업자는 전자세금계산서를 발급해야 하고(법 제32조제2항, 시행령 제68조제1항), 발급명세는 발급일 다음 날까지 국세청에 전송합니다(시행령 제68조제7항). 금액 기준은 개정될 수 있으며 현행 법령이 정본입니다.

선금 정산과 세금계산서 금액

선금은 기성이나 준공 대가를 받을 때마다 일부씩 정산합니다. 집행기준 제37조제1항은 기성부분 또는 기납부분의 대가를 지급할 때마다 다음 산식으로 계산한 선금정산액 이상을 정산하도록 정합니다. 검색어로는 '선금청산액'도 많이 쓰지만 집행기준 문언은 '선금정산액'입니다.

선금정산액 = 선금액 × [기성(또는 기납) 부분의 대가상당액 / 계약금액]

가상 사례로 계산하면 이렇습니다. A사의 계약금액이 10억원이고 선금 3억원을 받았다고 가정합니다.

회차	이번 대가상당액	선금정산액(최소)	누적 정산액	남은 선금
1회 기성	2억원	6천만원	6천만원	2억4천만원
2회 기성	3억원	9천만원	1억5천만원	1억5천만원
준공	5억원	1억5천만원	3억원	0원

산식이 정하는 것은 최소 정산액입니다. 이행기간이 끝나기 전에 선금을 모두 정산했다면, 신청할 경우 정산 완료를 증명하는 서류를 발급받을 수 있습니다(제37조제2항).

세금계산서를 언제 발급하는지는 부가가치세법이 정합니다. 세금계산서는 공급시기에 발급하는 것이 원칙입니다(법 제34조제1항). 공급시기 전에 대가를 받고 그 대가에 대해 세금계산서를 발급하면 발급한 때를 공급시기로 보고(법 제17조제1항), 먼저 발급한 뒤 7일 이내에 대가를 받아도 같습니다(제2항). 계약서에 대금 청구시기와 지급시기를 따로 적고 그 사이가 30일 이내인 경우 등은 7일이 지나 대가를 받아도 발급한 때를 공급시기로 봅니다(제3항).

국가계약 선금은 「국고금 관리법」 제26조의 선급으로 지급됩니다(집행기준 제33조, 국고금 관리법 시행령 제40조제1항제15호). 부가가치세법 시행규칙 제18조와 제20조는 국고금 관리법 제26조에 따라 경비를 미리 지급받는 경우를 중간지급조건부 공급으로 정하고, 시행령 제28조제3항과 제29조제1항은 중간지급조건부 공급의 공급시기를 대가의 각 부분을 받기로 한 때로 봅니다. 다만 인도나 역무 완료 뒤에 받기로 한 부분은 인도일이나 역무 완료일이 공급시기입니다.

선금을 청구할 때 세금계산서를 발행했다면, 이후 기성·준공 청구에서 세금계산서 금액을 정하기 전에 세 숫자를 맞춰 봅니다. 이미 세금계산서를 발행한 공급가액, 이번 회차 대가상당액, 이번 회차 선금정산액입니다. 나라장터 가이드와 계약예규에는 이 금액을 어떻게 잡는지 정한 문언이 없습니다. 같은 거래를 착오로 두 번 발급한 전자세금계산서는 시행령 제70조제1항제7호의 수정 사유이므로, 회차별 발급 금액은 계약 담당 부서와 세무 처리 기준으로 확정합니다.

선금과 관련한 세금계산서가 하나 더 있습니다. 2026년 4월 1일 신설된 집행기준 제36조제2항은 선금을 계약 목적에 맞게 썼는지 확인하려고 발주기관이 "선금사용내역서 및 세금계산서 등 증빙서류"를 내게 할 수 있다고 정합니다.

나라장터 세금계산서 오류와 해결

증상	원인과 조치(나라장터 FAQ)
"등록된 인증서가 아닙니다"	인증서 등록 여부, 허용 인증서인지, 회사 사업자번호 인증서인지 확인. 세금계산서 업무는 범용 공동인증서나 전자세금계산서용 금융인증서만 허용(FAQ 220)
[송신] 때 오류	사업자용 인증서가 등록되지 않았거나 사업자용이 아님. 인증서추가/삭제에서 등록하고 선택창에서 사업자 인증서 선택, 개인 인증서 선택 금지(FAQ 206)
Runtime Exception, "공인증서 인증을 취소 하였습니다"	브라우저 확장프로그램 충돌. 가상화폐 지갑, 광고 차단, PDF 도구 등 확장프로그램을 모두 끄고 새로고침(FAQ 221·217)
인증서 선택창에 하드디스크가 안 보임	PC가 모바일 기기로 인식된 경우. 인증기관의 클라우드 공동인증 서비스에 인증서를 저장하고 선택창에서 클라우드 사용(FAQ 219)
세금계산서 전송 실패	세금계산목록조회 → 재발급대상 → 정정세금계산서 재송신(FAQ 225)
기관이 청구서를 찾지 못함	기관 대금관리목록조회에서 담당자 조건을 빼고 조회. 담당자만 진행 가능 문구는 기관 대표수신자나 지정 담당자가 담당자를 이첩(FAQ 215·210)
대금청구서 반려	업체는 이행 > 검사검수 > 검사검수목록에서 대상 건의 [청구서작성]으로 다시 작성(FAQ 225)

국세청 시스템 작업으로 연계가 멈추는 때도 있습니다. 조달청은 2025년 10월 17일 18~~20시 국세청 서버인증서 교체 작업으로 전자세금계산서 연계 서비스가, 2026년 9월 19일 0~~7시 국세청 점검으로 세금계산서와 국세납세증명 연계가 중단된다고 공지했습니다. 2025년 9월 국가정보자원관리원 화재로 재해복구시스템을 가동했을 때는 "세금계산서 연계 안 될 경우 국세청 홈택스에서 발행 후 '나라장터 외 발급'으로 등록"하도록 안내했습니다. 이 방법은 그 기간에 나온 안내이므로, 연계 장애가 생기면 그때의 운영자 공지를 먼저 봅니다.

자주 묻는 질문 (FAQ)

Q. 나라장터 세금계산서는 어디서 발행하나요?

선금은 계약 > 계약체결 > 계약체결관리목록에서 [선금청구서]를 열고, 대금은 이행 > 검사검수 > 검사검수목록이나 이행 > 대금관리 > 대금관리목록에서 [대금청구서]를 엽니다. 두 청구서 화면 안에서 [세금계산서]로 발행해 송신합니다.

Q. 입찰용 인증서로 세금계산서를 발행할 수 있나요?

사업자용 범용 공동인증서라면 입찰과 세금계산서에 모두 씁니다. 사업자용 금융인증서는 세금계산서 업무에 전자세금계산서용만 허용되고, 사업자용 간편인증서는 전자세금계산서용 인증서를 따로 발급받아야 합니다.

Q. 세금계산서 전송이 실패하면 대금청구를 처음부터 다시 해야 하나요?

아닙니다. 이행 > 대금관리 > 세금계산목록조회에서 처리구분을 재발급대상으로 검색하고, 해당 건의 [정정세금계산서]로 재송신합니다. 작성일자, 수량·단가 소수점 자리, 거래명세내역 글자 수를 함께 확인합니다.

Q. 선금청산액은 어떻게 계산하나요?

집행기준 제37조의 선금정산액은 선금액에 기성(또는 기납) 부분 대가상당액을 계약금액으로 나눈 비율을 곱한 금액입니다. 기성이나 준공 대가를 받을 때마다 이 금액 이상을 정산합니다.

Q. 정정세금계산서와 수정세금계산서는 같은 것인가요?

다릅니다. 정정세금계산서는 나라장터에서 전송에 실패한 건을 다시 보내는 기능이고, 수정세금계산서는 부가가치세법 시행령 제70조의 사유(계약 해제, 공급가액 증감, 기재사항 착오, 이중 발급 등)가 생겼을 때 발급하는 세금계산서입니다.